دوره نهفتگی آنفولانزا به زمانی اطلاق می‌شود که ویروس وارد بدن شده و قبل از بروز علائم، دوره زمانی بین این دو مرحله را شامل می‌شود. این دوره می‌تواند متغیر باشد، اما معمولاً بین ۱ تا ۴ روز طول می‌کشد. در این مدت، فرد ممکن است بدون علامت باشد اما همچنان قابلیت سرایت ویروس را داشته باشد. درک این دوره برای اقدامات پیشگیرانه و کنترل شیوع بیماری اهمیت دارد.